TY - JOUR AU - Murphy, S. L. AU - Kochanek, K. D. AU - Xu, J. AU - Heron, M. PY - 2015 DA - 2015// TI - Deaths: final data for 2012 JO - Natl Vital Stat Rep Cent Dis Control Prev Natl Cent Health Stat Natl Vital Stat Syst VL - 63 ID - Murphy2015 ER - TY - JOUR AU - Celli, B. R. AU - MacNee, W. AU - Agusti, A. AU - Anzueto, A. AU - Berg, B. AU - Buist, A. S. AU - Calverley, P. M. A. AU - Chavannes, N. AU - Dillard, T. AU - Fahy, B. AU - Fein, A. AU - Heffner, J. AU - Lareau, S. AU - Meek, P. AU - Martinez, F. AU - McNicholas, W. AU - Muris, J. AU - Austegard, E. AU - Pauwels, R. AU - Rennard, S. AU - Rossi, A. AU - Siafakas, N. AU - Tiep, B. AU - Vestbo, J. AU - Wouters, E. AU - ZuWallack, R. PY - 2004 DA - 2004// TI - Standards for the diagnosis and treatment of patients with COPD: a summary of the ATS/ERS position paper JO - Eur Respir J VL - 23 UR - https://doi.org/10.1183/09031936.04.00014304 DO - 10.1183/09031936.04.00014304 ID - Celli2004 ER - TY - JOUR AU - Rabe, K. F. AU - Hurd, S. AU - Anzueto, A. AU - Barnes, P. J. AU - Buist, S. A. AU - Calverley, P. AU - Fukuchi, Y. AU - Jenkins, C. AU - Rodriguez-Roisin, R. AU - van Weel, C. AU - Zielinski, J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Global initiative for chronic obstructive lung disease. Global strategy for the diagnosis, management, and prevention of chronic obstructive pulmonary disease: GOLD executive summary JO - Am J Respir Crit Care Med VL - 176 UR - https://doi.org/10.1164/rccm.200703-456SO DO - 10.1164/rccm.200703-456SO ID - Rabe2007 ER - TY - JOUR AU - Han, M. K. AU - Agusti, A. AU - Calverley, P. M. AU - Celli, B. R. AU - Criner, G. AU - Curtis, J. L. AU - Fabbri, L. M. AU - Goldin, J. G. AU - Jones, P. W. AU - Macnee, W. AU - Make, B. J. AU - Rabe, K. F. AU - Rennard, S. I. AU - Sciurba, F. C. AU - Silverman, E. K. AU - Vestbo, J. AU - Washko, G. R. AU - Wouters, E. F. M. AU - Martinez, F. J. PY - 2010 DA - 2010// TI - Chronic obstructive pulmonary disease phenotypes: the future of COPD JO - Am J Respir Crit Care Med VL - 182 UR - https://doi.org/10.1164/rccm.200912-1843CC DO - 10.1164/rccm.200912-1843CC ID - Han2010 ER - TY - JOUR AU - Burrows, B. AU - Fletcher, C. M. AU - Heard, B. E. AU - Jones, N. L. AU - Wootliff, J. S. PY - 1966 DA - 1966// TI - The emphysematous and bronchial types of chronic airways obstruction: a Clinicopathological study of patients in London and Chicago JO - Lancet VL - 287 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(66)90181-4 DO - 10.1016/S0140-6736(66)90181-4 ID - Burrows1966 ER - TY - JOUR AU - Choi, S. AU - Hoffman, E. A. AU - Wenzel, S. E. AU - Castro, M. AU - Fain, S. B. AU - Jarjour, N. N. AU - Schiebler, M. L. AU - Chen, K. AU - Lin, C. -. L. PY - 2015 DA - 2015// TI - Quantitative assessment of multiscale structural and functional alterations in asthmatic populations JO - J Appl Physiol VL - 118 UR - https://doi.org/10.1152/japplphysiol.01094.2014 DO - 10.1152/japplphysiol.01094.2014 ID - Choi2015 ER - TY - JOUR AU - Choi, S. a. n. g. h. u. n. AU - Hoffman, E. r. i. c. A. AU - Wenzel, S. a. l. l. y. E. AU - Castro, M. a. r. i. o. AU - Fain, S. e. a. n. AU - Jarjour, N. i. z. a. r. AU - Schiebler, M. a. r. k. L. AU - Chen, K. u. n. AU - Lin, C. h. i. n. g. -. L. o. n. g. PY - 2017 DA - 2017// TI - Quantitative computed tomographic imaging–based clustering differentiates asthmatic subgroups with distinctive clinical phenotypes JO - Journal of Allergy and Clinical Immunology VL - 140 ID - Choi2017 ER - TY - JOUR AU - Hoffman, E. A. AU - Lynch, D. A. AU - Barr, R. G. AU - van Beek, E. J. R. AU - Parraga, G. PY - 2016 DA - 2016// TI - Pulmonary CT and MRI phenotypes that help explain chronic pulmonary obstruction disease pathophysiology and outcomes JO - J Magn Reson Imaging JMRI VL - 43 UR - https://doi.org/10.1002/jmri.25010 DO - 10.1002/jmri.25010 ID - Hoffman2016 ER - TY - JOUR AU - Cho, M. H. AU - Washko, G. R. AU - Hoffmann, T. J. AU - Criner, G. J. AU - Hoffman, E. A. AU - Martinez, F. J. AU - Laird, N. AU - Reilly, J. J. AU - Silverman, E. K. PY - 2010 DA - 2010// TI - Cluster analysis in severe emphysema subjects using phenotype and genotype data: an exploratory investigation JO - Respir Res VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/1465-9921-11-30 DO - 10.1186/1465-9921-11-30 ID - Cho2010 ER - TY - JOUR AU - Garcia-Aymerich, J. AU - Gómez, F. P. AU - Benet, M. AU - Farrero, E. AU - Basagaña, X. AU - Gayete, À. AU - Paré, C. AU - Freixa, X. AU - Ferrer, J. AU - Ferrer, A. AU - Roca, J. AU - Gáldiz, J. B. AU - Sauleda, J. AU - Monsó, E. AU - Gea, J. AU - Barberà, J. A. AU - Agustí, À. AU - Antó, J. M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Identification and prospective validation of clinically relevant chronic obstructive pulmonary disease (COPD) subtypes JO - Thorax VL - 66 UR - https://doi.org/10.1136/thx.2010.154484 DO - 10.1136/thx.2010.154484 ID - Garcia-Aymerich2011 ER - TY - JOUR AU - Paoletti, M. AU - Camiciottoli, G. AU - Meoni, E. AU - Bigazzi, F. AU - Cestelli, L. AU - Pistolesi, M. AU - Marchesi, C. PY - 2009 DA - 2009// TI - Explorative data analysis techniques and unsupervised clustering methods to support clinical assessment of chronic obstructive pulmonary disease (COPD) phenotypes JO - J Biomed Inform VL - 42 UR - https://doi.org/10.1016/j.jbi.2009.05.008 DO - 10.1016/j.jbi.2009.05.008 ID - Paoletti2009 ER - TY - JOUR AU - Moore, W. C. AU - Meyers, D. A. AU - Wenzel, S. E. AU - Teague, W. G. AU - Li, H. AU - Li, X. AU - D’Agostino, R. AU - Castro, M. AU - Curran-Everett, D. AU - Fitzpatrick, A. M. AU - Gaston, B. AU - Jarjour, N. N. AU - Sorkness, R. AU - Calhoun, W. J. AU - Chung, K. F. AU - SAA, C. AU - Dweik, R. A. AU - Israel, E. AU - Peters, S. P. AU - Busse, W. W. AU - Erzurum, S. C. AU - Bleecker, E. R. PY - 2010 DA - 2010// TI - Identification of asthma phenotypes using cluster analysis in the severe asthma research program JO - Am J Respir Crit Care Med VL - 181 UR - https://doi.org/10.1164/rccm.200906-0896OC DO - 10.1164/rccm.200906-0896OC ID - Moore2010 ER - TY - JOUR AU - Burgel, P. -. R. AU - Roche, N. AU - Paillasseur, J. -. L. AU - Tillie-Leblond, I. AU - Chanez, P. AU - Escamilla, R. AU - Court-Fortune, I. AU - Perez, T. AU - Carré, P. AU - Caillaud, D. PY - 2012 DA - 2012// TI - Clinical COPD phenotypes identified by cluster analysis: validation with mortality JO - Eur Respir J VL - 40 UR - https://doi.org/10.1183/09031936.00228511 DO - 10.1183/09031936.00228511 ID - Burgel2012 ER - TY - JOUR AU - Castaldi, P. J. AU - Dy, J. AU - Ross, J. AU - Chang, Y. AU - Washko, G. R. AU - Curran-Everett, D. AU - Williams, A. AU - Lynch, D. A. AU - Make, B. J. AU - Crapo, J. D. AU - Bowler, R. P. AU - Regan, E. A. AU - Hokanson, J. E. AU - Kinney, G. L. AU - Han, M. K. AU - Soler, X. AU - Ramsdell, J. W. AU - Barr, R. G. AU - Foreman, M. AU - van Beek, E. AU - Casaburi, R. AU - Criner, G. J. AU - Lutz, S. M. AU - Rennard, S. I. AU - Santorico, S. AU - Sciurba, F. C. AU - DeMeo, D. L. AU - Hersh, C. P. AU - Silverman, E. K. PY - 2014 DA - 2014// TI - Cluster analysis in the COPDGene study identifies subtypes of smokers with distinct patterns of airway disease and emphysema JO - Thorax VL - 69 UR - https://doi.org/10.1136/thoraxjnl-2013-203601 DO - 10.1136/thoraxjnl-2013-203601 ID - Castaldi2014 ER - TY - JOUR AU - Burgel, P. -. R. AU - Paillasseur, J. -. L. AU - Caillaud, D. AU - Tillie-Leblond, I. AU - Chanez, P. AU - Escamilla, R. AU - Court-Fortune, I. AU - Perez, T. AU - Carré, P. AU - Roche, N. PY - 2010 DA - 2010// TI - Initiatives BPCO scientific committee. Clinical COPD phenotypes: a novel approach using principal component and cluster analyses JO - Eur Respir J VL - 36 UR - https://doi.org/10.1183/09031936.00175109 DO - 10.1183/09031936.00175109 ID - Burgel2010 ER - TY - JOUR AU - Gagnon, P. AU - Casaburi, R. AU - Saey, D. AU - Porszasz, J. AU - Provencher, S. AU - Milot, J. AU - Bourbeau, J. AU - O’Donnell, D. E. AU - Maltais, F. PY - 2015 DA - 2015// TI - Cluster analysis in patients with GOLD 1 chronic obstructive pulmonary disease JO - PLoS One VL - 10 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0123626 DO - 10.1371/journal.pone.0123626 ID - Gagnon2015 ER - TY - JOUR AU - Castaldi, P. e. t. e. r. J. AU - Benet, M. a. r. t. a. AU - Petersen, H. a. n. s. AU - Rafaels, N. i. c. h. o. l. a. s. AU - Finigan, J. a. m. e. s. AU - Paoletti, M. a. t. t. e. o. AU - Marike Boezen, H. AU - Vonk, J. u. d. i. t. h. M. AU - Bowler, R. u. s. s. e. l. l. AU - Pistolesi, M. a. s. s. i. m. o. AU - Puhan, M. i. l. o. A. AU - Anto, J. o. s. e. p. AU - Wauters, E. l. s. AU - Lambrechts, D. i. e. t. h. e. r. AU - Janssens, W. i. m. AU - Bigazzi, F. r. a. n. c. e. s. c. a. AU - Camiciottoli, G. i. a. n. n. a. AU - Cho, M. i. c. h. a. e. l. H. AU - Hersh, C. r. a. i. g. P. AU - Barnes, K. a. t. h. l. e. e. n. AU - Rennard, S. t. e. p. h. e. n. AU - Boorgula, M. e. h. e. r. P. r. e. e. t. h. i. AU - Dy, J. e. n. n. i. f. e. r. AU - Hansel, N. a. d. i. a. N. AU - Crapo, J. a. m. e. s. D. AU - Tesfaigzi, Y. o. h. a. n. n. e. s. AU - Agusti, A. l. v. a. r. AU - Silverman, E. d. w. i. n. K. AU - Garcia-Aymerich, J. u. d. i. t. h. PY - 2017 DA - 2017// TI - Do COPD subtypes really exist? COPD heterogeneity and clustering in 10 independent cohorts JO - Thorax VL - 72 UR - https://doi.org/10.1136/thoraxjnl-2016-209846 DO - 10.1136/thoraxjnl-2016-209846 ID - Castaldi2017 ER - TY - JOUR AU - Choi, S. AU - Hoffman, E. A. AU - Wenzel, S. E. AU - Castro, M. AU - Lin, C. -. L. PY - 2014 DA - 2014// TI - Improved CT-based estimate of pulmonary gas trapping accounting for scanner and lung-volume variations in a multicenter asthmatic study JO - J Appl Physiol VL - 117 UR - https://doi.org/10.1152/japplphysiol.00280.2014 DO - 10.1152/japplphysiol.00280.2014 ID - Choi2014 ER - TY - JOUR AU - Couper, D. a. v. i. d. AU - LaVange, L. i. s. a. M. AU - Han, M. e. i. L. a. n. AU - Barr, R. G. r. a. h. a. m. AU - Bleecker, E. u. g. e. n. e. AU - Hoffman, E. r. i. c. A. AU - Kanner, R. i. c. h. a. r. d. AU - Kleerup, E. r. i. c. AU - Martinez, F. e. r. n. a. n. d. o. J. AU - Woodruff, P. r. e. s. c. o. t. t. G. AU - Rennard, S. t. e. p. h. e. n. PY - 2013 DA - 2013// TI - Design of the Subpopulations and Intermediate Outcomes in COPD Study (SPIROMICS): Table 1 JO - Thorax VL - 69 UR - https://doi.org/10.1136/thoraxjnl-2013-203897 DO - 10.1136/thoraxjnl-2013-203897 ID - Couper2013 ER - TY - STD TI - Multiscale Imaging-Based Clusters in the COPD Cohort Associates with Clinical Characteristics: The SubPopulations and InteRmediate Outcome Measures in COPD Study (SPIROMICS) - ajrccm-conference. 2016. 193.1_MeetingAbstracts. A6612. at http://www.atsjournals.org/doi/pdf/10.1164/ajrccm-conference.2016.193.1_MeetingAbstracts.A6612. UR - http://www.atsjournals.org/doi/pdf/10.1164/ajrccm-conference.2016.193.1_MeetingAbstracts.A6612 ID - ref20 ER - TY - JOUR AU - Hennig, C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Cluster-wise assessment of cluster stability JO - Comput Stat Data Anal VL - 52 UR - https://doi.org/10.1016/j.csda.2006.11.025 DO - 10.1016/j.csda.2006.11.025 ID - Hennig2007 ER - TY - JOUR AU - Shaker, S. a. h. e. r. B. AU - Stavngaard, T. r. i. n. e. AU - Laursen, L. a. r. s. C. h. r. i. s. t. i. a. n. AU - Stoel, B. e. r. e. n. d. C. AU - Dirksen, A. s. g. e. r. PY - 2011 DA - 2011// TI - Rapid Fall in Lung Density Following Smoking Cessation in COPD JO - COPD: Journal of Chronic Obstructive Pulmonary Disease VL - 8 UR - https://doi.org/10.3109/15412555.2010.541306 DO - 10.3109/15412555.2010.541306 ID - Shaker2011 ER - TY - JOUR AU - Sieren, J. P. AU - Newell, J. D. AU - Barr, R. G. AU - Bleecker, E. R. AU - Burnette, N. AU - Carretta, E. E. AU - Couper, D. AU - Goldin, J. AU - Guo, J. AU - Han, M. K. AU - Hansel, N. N. AU - Kanner, R. E. AU - Kazerooni, E. A. AU - Martinez, F. J. AU - Rennard, S. AU - Woodruff, P. G. AU - Hoffman, E. A. PY - 2016 DA - 2016// TI - SPIROMICS protocol for multicenter quantitative computed tomography to phenotype the lungs JO - Am J Respir Crit Care Med VL - 194 UR - https://doi.org/10.1164/rccm.201506-1208PP DO - 10.1164/rccm.201506-1208PP ID - Sieren2016 ER - TY - JOUR AU - Yin, Y. AU - Hoffman, E. A. AU - Lin, C. -. L. PY - 2009 DA - 2009// TI - Mass preserving nonrigid registration of CT lung images using cubic B-spline JO - Med Phys VL - 36 UR - https://doi.org/10.1118/1.3193526 DO - 10.1118/1.3193526 ID - Yin2009 ER - TY - JOUR AU - Haghighi, B. a. b. a. k. AU - D. Ellingwood, N. a. t. h. a. n. AU - Yin, Y. o. u. b. i. n. g. AU - Hoffman, E. r. i. c. A. AU - Lin, C. h. i. n. g. -. L. o. n. g. PY - 2017 DA - 2017// TI - A GPU-based symmetric non-rigid image registration method in human lung JO - Medical & Biological Engineering & Computing VL - 56 UR - https://doi.org/10.1007/s11517-017-1690-2 DO - 10.1007/s11517-017-1690-2 ID - Haghighi2017 ER - TY - JOUR AU - Amelon, R. AU - Cao, K. AU - Ding, K. AU - Christensen, G. E. AU - Reinhardt, J. M. AU - Raghavan, M. L. PY - 2011 DA - 2011// TI - Three-dimensional characterization of regional lung deformation JO - J Biomech VL - 44 UR - https://doi.org/10.1016/j.jbiomech.2011.06.009 DO - 10.1016/j.jbiomech.2011.06.009 ID - Amelon2011 ER - TY - JOUR AU - Jahani, N. AU - Yin, Y. AU - Hoffman, E. A. AU - Lin, C. -. L. PY - 2014 DA - 2014// TI - Assessment of regional non-linear tissue deformation and air volume change of human lungs via image registration JO - J Biomech VL - 47 UR - https://doi.org/10.1016/j.jbiomech.2014.02.040 DO - 10.1016/j.jbiomech.2014.02.040 ID - Jahani2014 ER - TY - JOUR AU - Galbán, C. J. AU - Han, M. K. AU - Boes, J. L. AU - Chughtai, K. A. AU - Meyer, C. R. AU - Johnson, T. D. AU - Galbán, S. AU - Rehemtulla, A. AU - Kazerooni, E. A. AU - Martinez, F. J. AU - Ross, B. D. PY - 2012 DA - 2012// TI - Computed tomography–based biomarker provides unique signature for diagnosis of COPD phenotypes and disease progression JO - Nat Med VL - 18 UR - https://doi.org/10.1038/nm.2971 DO - 10.1038/nm.2971 ID - Galbán2012 ER - TY - JOUR AU - Jain, A. K. AU - Murty, M. N. AU - Flynn, P. J. PY - 1999 DA - 1999// TI - Data clustering: a review JO - ACM Comput Surv CSUR VL - 31 UR - https://doi.org/10.1145/331499.331504 DO - 10.1145/331499.331504 ID - Jain1999 ER - TY - JOUR AU - Fraley, C. AU - Raftery, A. E. PY - 2002 DA - 2002// TI - Model-based clustering, discriminant analysis, and density estimation JO - J Am Stat Assoc VL - 97 UR - https://doi.org/10.1198/016214502760047131 DO - 10.1198/016214502760047131 ID - Fraley2002 ER - TY - STD TI - clValid: An R Package for Cluster Validation | Brock | Journal of Statistical Software. 2008. https://www.jstatsoft.org/article/view/v025i04. UR - https://www.jstatsoft.org/article/view/v025i04 ID - ref31 ER - TY - STD TI - NbClust function | R Documentation. 2015. https://www.rdocumentation.org/packages/NbClust/versions/3.0/topics/NbClust. UR - https://www.rdocumentation.org/packages/NbClust/versions/3.0/topics/NbClust ID - ref32 ER - TY - JOUR AU - Hayton, J. C. AU - Allen, D. G. AU - Scarpello, V. PY - 2004 DA - 2004// TI - Factor retention decisions in exploratory factor analysis: a tutorial on parallel analysis JO - Organ Res Methods VL - 7 UR - https://doi.org/10.1177/1094428104263675 DO - 10.1177/1094428104263675 ID - Hayton2004 ER - TY - STD TI - Data Analysis and Decision Support | Daniel Baier | Springer 2005. http://www.springer.com/us/book/9783540260073. UR - http://www.springer.com/us/book/9783540260073 ID - ref34 ER - TY - JOUR AU - Woodruff, P. G. AU - Barr, R. G. AU - Bleecker, E. AU - Christenson, S. A. AU - Couper, D. AU - Curtis, J. L. AU - Gouskova, N. A. AU - Hansel, N. N. AU - Hoffman, E. A. AU - Kanner, R. E. AU - Kleerup, E. AU - Lazarus, S. C. AU - Martinez, F. J. AU - Paine, R. I. AU - Rennard, S. AU - Tashkin, D. P. AU - Han, M. K. PY - 2016 DA - 2016// TI - Clinical significance of symptoms in smokers with preserved pulmonary function JO - N Engl J Med VL - 374 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa1505971 DO - 10.1056/NEJMoa1505971 ID - Woodruff2016 ER - TY - JOUR AU - Smith, B. AU - Hoffman, E. AU - Donohue, K. AU - Rabinowitz, D. AU - Barr, R. G. PY - 2013 DA - 2013// TI - Airway wall thinness and COPD: analysis of spatially comparable airways. The MESA COPD study JO - Eur Respir J VL - 42 UR - https://doi.org/10.1183/09031936.00124012 DO - 10.1183/09031936.00124012 ID - Smith2013 ER - TY - JOUR AU - Wan, E. S. AU - Castaldi, P. J. AU - Cho, M. H. AU - Hokanson, J. E. AU - Regan, E. A. AU - Make, B. J. AU - Beaty, T. H. AU - Han, M. K. AU - Curtis, J. L. AU - Curran-Everett, D. AU - Lynch, D. A. AU - DeMeo, D. L. AU - Crapo, J. D. AU - Silverman, E. K. PY - 2014 DA - 2014// TI - Epidemiology, genetics, and subtyping of preserved ratio impaired spirometry (PRISm) in COPDGene JO - Respir Res VL - 15 UR - https://doi.org/10.1186/s12931-014-0089-y DO - 10.1186/s12931-014-0089-y ID - Wan2014 ER - TY - JOUR AU - Sood, A. PY - 2010 DA - 2010// TI - Obesity, Adipokines, and lung disease JO - J Appl Physiol Bethesda Md 1985 VL - 108 ID - Sood2010 ER -